scATAC-seq는 단일 세포 수준에서 크로마틴 접근성(Chromatin Accessibility)을 측정하여, 다양한 외부 자극에 반응하는 면역세포 집단의 개별적인 유전체 개방성을 높은 해상도로 분석하는 방법론이다.
분석 워크플로우 및 핵심 기법
- 세포 분리 및 처리: 고품질의 림프구 등 면역세포를 분리하고, 첨단 자동화 플랫폼을 사용하여 각 세포마다 독립적으로 크로마틴을 추출한다.
- 순차적 엔드포인트(Sequencing Endpoints): 세포별로 확보된 접근성 정보를 이용하여 ATAC-seq 라이브러리를 구축하고, 이를 차세대 염기서열 분석(Next-Generation Sequencing)한다.
- 데이터 분석: 얻어진 데이터는 단일세포 분석(Single-Cell Analysis) 소프트웨어를 통해 전처리되며, 특정 자극군 대비 정상군에서의 프로모터 영역 및 인핸서 영역의 변화를 통계적으로 비교하여 잠재적 조절 요소를 식별한다.
이 기법은 특정 사이토카인이나 병원체 자극에 의해 발생하는 면역 반응의 초기 단계 및 세포 유형별 차등적인 유전자 발현 조절 메커니즘 규명에 필수적이다. 시스템 생물학적 관점에서 면역 반응의 시작 지점을 찾는 데 기여한다.
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